Protein–RNA interactions for Protein: A2A958

C87977, Expressed sequence C87977, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87977A2A958 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C87977A2A958 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C87977A2A958 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C87977A2A958 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C87977A2A958 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C87977A2A958 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C87977A2A958 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C87977A2A958 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C87977A2A958 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C87977A2A958 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C87977A2A958 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C87977A2A958 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C87977A2A958 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C87977A2A958 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C87977A2A958 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C87977A2A958 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C87977A2A958 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C87977A2A958 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
C87977A2A958 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C87977A2A958 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C87977A2A958 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C87977A2A958 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C87977A2A958 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C87977A2A958 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C87977A2A958 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C87977A2A958 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C87977A2A958 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C87977A2A958 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C87977A2A958 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C87977A2A958 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C87977A2A958 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C87977A2A958 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C87977A2A958 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C87977A2A958 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C87977A2A958 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C87977A2A958 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C87977A2A958 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C87977A2A958 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C87977A2A958 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C87977A2A958 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C87977A2A958 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C87977A2A958 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C87977A2A958 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C87977A2A958 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C87977A2A958 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C87977A2A958 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
C87977A2A958 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C87977A2A958 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C87977A2A958 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C87977A2A958 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C87977A2A958 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C87977A2A958 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C87977A2A958 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C87977A2A958 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C87977A2A958 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C87977A2A958 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
C87977A2A958 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C87977A2A958 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
C87977A2A958 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C87977A2A958 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C87977A2A958 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C87977A2A958 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C87977A2A958 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C87977A2A958 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C87977A2A958 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
C87977A2A958 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C87977A2A958 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C87977A2A958 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
C87977A2A958 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
C87977A2A958 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
C87977A2A958 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C87977A2A958 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C87977A2A958 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C87977A2A958 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C87977A2A958 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C87977A2A958 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C87977A2A958 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C87977A2A958 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C87977A2A958 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C87977A2A958 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
C87977A2A958 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C87977A2A958 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C87977A2A958 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C87977A2A958 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
C87977A2A958 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C87977A2A958 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C87977A2A958 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C87977A2A958 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C87977A2A958 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C87977A2A958 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C87977A2A958 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C87977A2A958 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C87977A2A958 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C87977A2A958 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
C87977A2A958 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C87977A2A958 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C87977A2A958 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C87977A2A958 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C87977A2A958 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C87977A2A958 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms