Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trav12-2A0N8N6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trav12-2A0N8N6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trav12-2A0N8N6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trav12-2A0N8N6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trav12-2A0N8N6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trav12-2A0N8N6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trav12-2A0N8N6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trav12-2A0N8N6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trav12-2A0N8N6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trav12-2A0N8N6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trav12-2A0N8N6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trav12-2A0N8N6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trav12-2A0N8N6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trav12-2A0N8N6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trav12-2A0N8N6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trav12-2A0N8N6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trav12-2A0N8N6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trav12-2A0N8N6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trav12-2A0N8N6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trav12-2A0N8N6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trav12-2A0N8N6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trav12-2A0N8N6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trav12-2A0N8N6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trav12-2A0N8N6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trav12-2A0N8N6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trav12-2A0N8N6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trav12-2A0N8N6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trav12-2A0N8N6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trav12-2A0N8N6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trav12-2A0N8N6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trav12-2A0N8N6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trav12-2A0N8N6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trav12-2A0N8N6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trav12-2A0N8N6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trav12-2A0N8N6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trav12-2A0N8N6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trav12-2A0N8N6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trav12-2A0N8N6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trav12-2A0N8N6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trav12-2A0N8N6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trav12-2A0N8N6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms