Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc173A0JLY1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc173A0JLY1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc173A0JLY1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc173A0JLY1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc173A0JLY1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc173A0JLY1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc173A0JLY1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc173A0JLY1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc173A0JLY1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc173A0JLY1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms