Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSI2

1700018G05Rik, RIKEN cDNA 1700018G05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms