Protein–RNA interactions for Protein: A0A140T8N6

Trbv13-2, T cell receptor beta, variable 13-2 (Fragment), mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trbv13-2A0A140T8N6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Trbv13-2A0A140T8N6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Trbv13-2A0A140T8N6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Trbv13-2A0A140T8N6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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