Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H3

Trbv16, T cell receptor beta, variable 16 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv16A0A0B4J1H3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv16A0A0B4J1H3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv16A0A0B4J1H3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv16A0A0B4J1H3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv16A0A0B4J1H3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv16A0A0B4J1H3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv16A0A0B4J1H3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv16A0A0B4J1H3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv16A0A0B4J1H3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv16A0A0B4J1H3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv16A0A0B4J1H3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv16A0A0B4J1H3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv16A0A0B4J1H3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv16A0A0B4J1H3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv16A0A0B4J1H3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv16A0A0B4J1H3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv16A0A0B4J1H3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv16A0A0B4J1H3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trbv16A0A0B4J1H3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv16A0A0B4J1H3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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