Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YWX0

Ighv1-19, Immunoglobulin heavy variable V1-19 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv1-19A0A0A6YWX0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv1-19A0A0A6YWX0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv1-19A0A0A6YWX0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv1-19A0A0A6YWX0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv1-19A0A0A6YWX0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv1-19A0A0A6YWX0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ighv1-19A0A0A6YWX0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ighv1-19A0A0A6YWX0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ighv1-19A0A0A6YWX0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms