Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN8

Gm5114, MCG1026354, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5114W4VSN8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm5114W4VSN8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm5114W4VSN8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm5114W4VSN8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm5114W4VSN8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm5114W4VSN8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm5114W4VSN8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm5114W4VSN8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm5114W4VSN8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm5114W4VSN8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm5114W4VSN8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm5114W4VSN8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm5114W4VSN8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm5114W4VSN8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm5114W4VSN8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm5114W4VSN8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm5114W4VSN8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm5114W4VSN8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm5114W4VSN8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm5114W4VSN8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm5114W4VSN8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm5114W4VSN8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm5114W4VSN8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm5114W4VSN8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm5114W4VSN8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm5114W4VSN8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm5114W4VSN8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm5114W4VSN8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm5114W4VSN8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Gm5114W4VSN8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms