Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms