Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z306

Slc22a4, Solute carrier family 22 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a4Q9Z306 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc22a4Q9Z306 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc22a4Q9Z306 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc22a4Q9Z306 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc22a4Q9Z306 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc22a4Q9Z306 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc22a4Q9Z306 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc22a4Q9Z306 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc22a4Q9Z306 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc22a4Q9Z306 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc22a4Q9Z306 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc22a4Q9Z306 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc22a4Q9Z306 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc22a4Q9Z306 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc22a4Q9Z306 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc22a4Q9Z306 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc22a4Q9Z306 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc22a4Q9Z306 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc22a4Q9Z306 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc22a4Q9Z306 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc22a4Q9Z306 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc22a4Q9Z306 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc22a4Q9Z306 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc22a4Q9Z306 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc22a4Q9Z306 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc22a4Q9Z306 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc22a4Q9Z306 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc22a4Q9Z306 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc22a4Q9Z306 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc22a4Q9Z306 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc22a4Q9Z306 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc22a4Q9Z306 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc22a4Q9Z306 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc22a4Q9Z306 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc22a4Q9Z306 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc22a4Q9Z306 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc22a4Q9Z306 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc22a4Q9Z306 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc22a4Q9Z306 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc22a4Q9Z306 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc22a4Q9Z306 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc22a4Q9Z306 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc22a4Q9Z306 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc22a4Q9Z306 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc22a4Q9Z306 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc22a4Q9Z306 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc22a4Q9Z306 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc22a4Q9Z306 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc22a4Q9Z306 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc22a4Q9Z306 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc22a4Q9Z306 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc22a4Q9Z306 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc22a4Q9Z306 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc22a4Q9Z306 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc22a4Q9Z306 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms