Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E1

Mbd2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd2Q9Z2E1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms