Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1W8

Atp12a, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp12aQ9Z1W8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp12aQ9Z1W8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp12aQ9Z1W8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp12aQ9Z1W8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp12aQ9Z1W8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp12aQ9Z1W8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp12aQ9Z1W8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp12aQ9Z1W8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp12aQ9Z1W8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp12aQ9Z1W8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp12aQ9Z1W8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp12aQ9Z1W8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp12aQ9Z1W8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp12aQ9Z1W8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp12aQ9Z1W8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp12aQ9Z1W8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp12aQ9Z1W8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp12aQ9Z1W8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp12aQ9Z1W8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp12aQ9Z1W8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp12aQ9Z1W8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp12aQ9Z1W8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp12aQ9Z1W8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp12aQ9Z1W8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp12aQ9Z1W8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms