Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ap3b1Q9Z1T1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ap3b1Q9Z1T1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ap3b1Q9Z1T1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ap3b1Q9Z1T1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ap3b1Q9Z1T1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ap3b1Q9Z1T1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ap3b1Q9Z1T1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ap3b1Q9Z1T1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ap3b1Q9Z1T1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ap3b1Q9Z1T1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ap3b1Q9Z1T1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ap3b1Q9Z1T1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ap3b1Q9Z1T1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ap3b1Q9Z1T1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ap3b1Q9Z1T1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ap3b1Q9Z1T1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ap3b1Q9Z1T1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ap3b1Q9Z1T1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ap3b1Q9Z1T1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ap3b1Q9Z1T1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Ap3b1Q9Z1T1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Ap3b1Q9Z1T1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Ap3b1Q9Z1T1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ap3b1Q9Z1T1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ap3b1Q9Z1T1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ap3b1Q9Z1T1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ap3b1Q9Z1T1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ap3b1Q9Z1T1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ap3b1Q9Z1T1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ap3b1Q9Z1T1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ap3b1Q9Z1T1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Ap3b1Q9Z1T1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ap3b1Q9Z1T1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ap3b1Q9Z1T1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ap3b1Q9Z1T1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ap3b1Q9Z1T1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ap3b1Q9Z1T1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ap3b1Q9Z1T1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ap3b1Q9Z1T1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ap3b1Q9Z1T1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Ap3b1Q9Z1T1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ap3b1Q9Z1T1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ap3b1Q9Z1T1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ap3b1Q9Z1T1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ap3b1Q9Z1T1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ap3b1Q9Z1T1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ap3b1Q9Z1T1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ap3b1Q9Z1T1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ap3b1Q9Z1T1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ap3b1Q9Z1T1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ap3b1Q9Z1T1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ap3b1Q9Z1T1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ap3b1Q9Z1T1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ap3b1Q9Z1T1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ap3b1Q9Z1T1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Ap3b1Q9Z1T1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Ap3b1Q9Z1T1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ap3b1Q9Z1T1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ap3b1Q9Z1T1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ap3b1Q9Z1T1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ap3b1Q9Z1T1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ap3b1Q9Z1T1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ap3b1Q9Z1T1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ap3b1Q9Z1T1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Ap3b1Q9Z1T1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ap3b1Q9Z1T1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ap3b1Q9Z1T1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ap3b1Q9Z1T1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Ap3b1Q9Z1T1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Ap3b1Q9Z1T1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ap3b1Q9Z1T1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ap3b1Q9Z1T1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ap3b1Q9Z1T1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ap3b1Q9Z1T1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ap3b1Q9Z1T1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ap3b1Q9Z1T1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Ap3b1Q9Z1T1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ap3b1Q9Z1T1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ap3b1Q9Z1T1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ap3b1Q9Z1T1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ap3b1Q9Z1T1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ap3b1Q9Z1T1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ap3b1Q9Z1T1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ap3b1Q9Z1T1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ap3b1Q9Z1T1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ap3b1Q9Z1T1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Ap3b1Q9Z1T1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ap3b1Q9Z1T1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ap3b1Q9Z1T1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms