Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VarsQ9Z1Q9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VarsQ9Z1Q9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VarsQ9Z1Q9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VarsQ9Z1Q9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
VarsQ9Z1Q9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VarsQ9Z1Q9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
VarsQ9Z1Q9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VarsQ9Z1Q9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VarsQ9Z1Q9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VarsQ9Z1Q9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VarsQ9Z1Q9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VarsQ9Z1Q9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VarsQ9Z1Q9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VarsQ9Z1Q9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VarsQ9Z1Q9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VarsQ9Z1Q9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VarsQ9Z1Q9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VarsQ9Z1Q9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VarsQ9Z1Q9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VarsQ9Z1Q9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VarsQ9Z1Q9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
VarsQ9Z1Q9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VarsQ9Z1Q9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VarsQ9Z1Q9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VarsQ9Z1Q9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VarsQ9Z1Q9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VarsQ9Z1Q9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VarsQ9Z1Q9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VarsQ9Z1Q9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VarsQ9Z1Q9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VarsQ9Z1Q9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VarsQ9Z1Q9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VarsQ9Z1Q9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VarsQ9Z1Q9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VarsQ9Z1Q9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VarsQ9Z1Q9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VarsQ9Z1Q9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
VarsQ9Z1Q9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VarsQ9Z1Q9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
VarsQ9Z1Q9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VarsQ9Z1Q9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VarsQ9Z1Q9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VarsQ9Z1Q9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VarsQ9Z1Q9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
VarsQ9Z1Q9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VarsQ9Z1Q9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VarsQ9Z1Q9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VarsQ9Z1Q9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VarsQ9Z1Q9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VarsQ9Z1Q9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VarsQ9Z1Q9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VarsQ9Z1Q9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VarsQ9Z1Q9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VarsQ9Z1Q9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VarsQ9Z1Q9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VarsQ9Z1Q9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VarsQ9Z1Q9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
VarsQ9Z1Q9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VarsQ9Z1Q9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VarsQ9Z1Q9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VarsQ9Z1Q9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
VarsQ9Z1Q9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VarsQ9Z1Q9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VarsQ9Z1Q9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VarsQ9Z1Q9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VarsQ9Z1Q9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VarsQ9Z1Q9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VarsQ9Z1Q9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms