Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NfkbiaQ9Z1E3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NfkbiaQ9Z1E3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NfkbiaQ9Z1E3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NfkbiaQ9Z1E3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NfkbiaQ9Z1E3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NfkbiaQ9Z1E3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NfkbiaQ9Z1E3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NfkbiaQ9Z1E3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms