Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z172

Sumo3, Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3Q9Z172 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms