Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sh3bp5Q9Z131 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sh3bp5Q9Z131 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sh3bp5Q9Z131 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sh3bp5Q9Z131 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh3bp5Q9Z131 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh3bp5Q9Z131 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh3bp5Q9Z131 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh3bp5Q9Z131 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh3bp5Q9Z131 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh3bp5Q9Z131 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh3bp5Q9Z131 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh3bp5Q9Z131 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh3bp5Q9Z131 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh3bp5Q9Z131 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh3bp5Q9Z131 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh3bp5Q9Z131 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3bp5Q9Z131 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3bp5Q9Z131 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3bp5Q9Z131 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3bp5Q9Z131 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3bp5Q9Z131 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3bp5Q9Z131 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3bp5Q9Z131 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3bp5Q9Z131 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3bp5Q9Z131 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3bp5Q9Z131 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3bp5Q9Z131 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3bp5Q9Z131 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3bp5Q9Z131 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3bp5Q9Z131 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3bp5Q9Z131 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3bp5Q9Z131 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3bp5Q9Z131 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3bp5Q9Z131 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3bp5Q9Z131 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3bp5Q9Z131 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3bp5Q9Z131 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3bp5Q9Z131 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3bp5Q9Z131 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3bp5Q9Z131 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3bp5Q9Z131 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3bp5Q9Z131 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3bp5Q9Z131 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3bp5Q9Z131 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3bp5Q9Z131 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3bp5Q9Z131 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3bp5Q9Z131 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3bp5Q9Z131 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh3bp5Q9Z131 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh3bp5Q9Z131 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh3bp5Q9Z131 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh3bp5Q9Z131 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh3bp5Q9Z131 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh3bp5Q9Z131 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh3bp5Q9Z131 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh3bp5Q9Z131 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh3bp5Q9Z131 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh3bp5Q9Z131 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh3bp5Q9Z131 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh3bp5Q9Z131 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh3bp5Q9Z131 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Sh3bp5Q9Z131 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh3bp5Q9Z131 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh3bp5Q9Z131 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh3bp5Q9Z131 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh3bp5Q9Z131 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh3bp5Q9Z131 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh3bp5Q9Z131 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh3bp5Q9Z131 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh3bp5Q9Z131 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh3bp5Q9Z131 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh3bp5Q9Z131 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh3bp5Q9Z131 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh3bp5Q9Z131 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh3bp5Q9Z131 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3bp5Q9Z131 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3bp5Q9Z131 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3bp5Q9Z131 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3bp5Q9Z131 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3bp5Q9Z131 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3bp5Q9Z131 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3bp5Q9Z131 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms