Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skp2Q9Z0Z3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms