Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NgfrQ9Z0W1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms