Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0T9

Itgb6, Integrin beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb6Q9Z0T9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms