Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV55

Vapa, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapaQ9WV55 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VapaQ9WV55 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
VapaQ9WV55 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms