Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV31

Arc, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArcQ9WV31 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ArcQ9WV31 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ArcQ9WV31 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ArcQ9WV31 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ArcQ9WV31 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ArcQ9WV31 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ArcQ9WV31 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ArcQ9WV31 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ArcQ9WV31 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ArcQ9WV31 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ArcQ9WV31 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ArcQ9WV31 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ArcQ9WV31 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ArcQ9WV31 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ArcQ9WV31 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ArcQ9WV31 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ArcQ9WV31 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ArcQ9WV31 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ArcQ9WV31 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ArcQ9WV31 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ArcQ9WV31 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ArcQ9WV31 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ArcQ9WV31 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ArcQ9WV31 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ArcQ9WV31 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ArcQ9WV31 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ArcQ9WV31 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ArcQ9WV31 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ArcQ9WV31 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ArcQ9WV31 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ArcQ9WV31 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ArcQ9WV31 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ArcQ9WV31 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ArcQ9WV31 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ArcQ9WV31 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ArcQ9WV31 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ArcQ9WV31 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ArcQ9WV31 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ArcQ9WV31 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ArcQ9WV31 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ArcQ9WV31 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ArcQ9WV31 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ArcQ9WV31 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ArcQ9WV31 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ArcQ9WV31 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ArcQ9WV31 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ArcQ9WV31 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ArcQ9WV31 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ArcQ9WV31 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ArcQ9WV31 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ArcQ9WV31 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ArcQ9WV31 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ArcQ9WV31 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ArcQ9WV31 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ArcQ9WV31 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ArcQ9WV31 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ArcQ9WV31 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ArcQ9WV31 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ArcQ9WV31 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ArcQ9WV31 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ArcQ9WV31 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ArcQ9WV31 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ArcQ9WV31 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ArcQ9WV31 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ArcQ9WV31 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ArcQ9WV31 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ArcQ9WV31 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ArcQ9WV31 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ArcQ9WV31 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ArcQ9WV31 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ArcQ9WV31 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ArcQ9WV31 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ArcQ9WV31 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ArcQ9WV31 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ArcQ9WV31 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ArcQ9WV31 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ArcQ9WV31 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ArcQ9WV31 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ArcQ9WV31 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ArcQ9WV31 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ArcQ9WV31 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ArcQ9WV31 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ArcQ9WV31 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ArcQ9WV31 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ArcQ9WV31 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ArcQ9WV31 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ArcQ9WV31 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ArcQ9WV31 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ArcQ9WV31 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ArcQ9WV31 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ArcQ9WV31 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ArcQ9WV31 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ArcQ9WV31 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ArcQ9WV31 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ArcQ9WV31 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ArcQ9WV31 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ArcQ9WV31 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ArcQ9WV31 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ArcQ9WV31 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ArcQ9WV31 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms