Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP4

Srd5a3, Polyprenol reductase, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srd5a3Q9WUP4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srd5a3Q9WUP4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srd5a3Q9WUP4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srd5a3Q9WUP4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srd5a3Q9WUP4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srd5a3Q9WUP4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srd5a3Q9WUP4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srd5a3Q9WUP4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srd5a3Q9WUP4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srd5a3Q9WUP4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srd5a3Q9WUP4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srd5a3Q9WUP4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Srd5a3Q9WUP4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Srd5a3Q9WUP4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Srd5a3Q9WUP4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Srd5a3Q9WUP4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Srd5a3Q9WUP4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Srd5a3Q9WUP4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Srd5a3Q9WUP4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Srd5a3Q9WUP4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srd5a3Q9WUP4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srd5a3Q9WUP4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srd5a3Q9WUP4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srd5a3Q9WUP4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srd5a3Q9WUP4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srd5a3Q9WUP4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srd5a3Q9WUP4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srd5a3Q9WUP4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Srd5a3Q9WUP4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srd5a3Q9WUP4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srd5a3Q9WUP4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srd5a3Q9WUP4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srd5a3Q9WUP4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srd5a3Q9WUP4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srd5a3Q9WUP4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Srd5a3Q9WUP4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Srd5a3Q9WUP4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Srd5a3Q9WUP4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Srd5a3Q9WUP4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Srd5a3Q9WUP4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Srd5a3Q9WUP4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms