Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUF2

Egr4, Early growth response protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr4Q9WUF2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Egr4Q9WUF2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Egr4Q9WUF2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Egr4Q9WUF2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Egr4Q9WUF2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Egr4Q9WUF2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Egr4Q9WUF2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Egr4Q9WUF2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Egr4Q9WUF2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Egr4Q9WUF2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Egr4Q9WUF2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Egr4Q9WUF2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Egr4Q9WUF2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Egr4Q9WUF2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Egr4Q9WUF2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Egr4Q9WUF2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Egr4Q9WUF2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Egr4Q9WUF2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Egr4Q9WUF2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Egr4Q9WUF2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Egr4Q9WUF2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Egr4Q9WUF2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Egr4Q9WUF2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Egr4Q9WUF2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Egr4Q9WUF2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Egr4Q9WUF2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Egr4Q9WUF2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Egr4Q9WUF2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Egr4Q9WUF2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Egr4Q9WUF2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Egr4Q9WUF2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Egr4Q9WUF2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Egr4Q9WUF2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Egr4Q9WUF2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Egr4Q9WUF2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Egr4Q9WUF2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Egr4Q9WUF2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Egr4Q9WUF2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Egr4Q9WUF2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Egr4Q9WUF2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Egr4Q9WUF2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Egr4Q9WUF2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Egr4Q9WUF2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Egr4Q9WUF2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Egr4Q9WUF2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Egr4Q9WUF2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Egr4Q9WUF2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Egr4Q9WUF2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Egr4Q9WUF2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Egr4Q9WUF2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Egr4Q9WUF2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Egr4Q9WUF2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Egr4Q9WUF2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Egr4Q9WUF2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Egr4Q9WUF2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Egr4Q9WUF2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Egr4Q9WUF2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Egr4Q9WUF2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Egr4Q9WUF2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Egr4Q9WUF2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Egr4Q9WUF2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Egr4Q9WUF2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Egr4Q9WUF2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Egr4Q9WUF2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Egr4Q9WUF2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Egr4Q9WUF2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Egr4Q9WUF2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Egr4Q9WUF2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Egr4Q9WUF2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Egr4Q9WUF2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Egr4Q9WUF2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Egr4Q9WUF2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Egr4Q9WUF2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Egr4Q9WUF2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Egr4Q9WUF2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Egr4Q9WUF2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Egr4Q9WUF2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Egr4Q9WUF2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Egr4Q9WUF2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Egr4Q9WUF2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Egr4Q9WUF2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Egr4Q9WUF2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Egr4Q9WUF2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Egr4Q9WUF2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Egr4Q9WUF2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Egr4Q9WUF2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Egr4Q9WUF2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Egr4Q9WUF2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Egr4Q9WUF2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Egr4Q9WUF2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Egr4Q9WUF2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Egr4Q9WUF2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Egr4Q9WUF2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Egr4Q9WUF2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Egr4Q9WUF2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Egr4Q9WUF2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Egr4Q9WUF2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Egr4Q9WUF2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Egr4Q9WUF2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Egr4Q9WUF2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms