Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUD1

Stub1, STIP1 homology and U box-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stub1Q9WUD1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Stub1Q9WUD1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Stub1Q9WUD1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Stub1Q9WUD1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Stub1Q9WUD1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Stub1Q9WUD1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Stub1Q9WUD1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Stub1Q9WUD1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stub1Q9WUD1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stub1Q9WUD1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stub1Q9WUD1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stub1Q9WUD1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stub1Q9WUD1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stub1Q9WUD1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Stub1Q9WUD1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stub1Q9WUD1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stub1Q9WUD1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stub1Q9WUD1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Stub1Q9WUD1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Stub1Q9WUD1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Stub1Q9WUD1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Stub1Q9WUD1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Stub1Q9WUD1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Stub1Q9WUD1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Stub1Q9WUD1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Stub1Q9WUD1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Stub1Q9WUD1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Stub1Q9WUD1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Stub1Q9WUD1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Stub1Q9WUD1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Stub1Q9WUD1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Stub1Q9WUD1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Stub1Q9WUD1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Stub1Q9WUD1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Stub1Q9WUD1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Stub1Q9WUD1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Stub1Q9WUD1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Stub1Q9WUD1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Stub1Q9WUD1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms