Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms