Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX5

Skp1, S-phase kinase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp1Q9WTX5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Skp1Q9WTX5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Skp1Q9WTX5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Skp1Q9WTX5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Skp1Q9WTX5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Skp1Q9WTX5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Skp1Q9WTX5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Skp1Q9WTX5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Skp1Q9WTX5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Skp1Q9WTX5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Skp1Q9WTX5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Skp1Q9WTX5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Skp1Q9WTX5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Skp1Q9WTX5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Skp1Q9WTX5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Skp1Q9WTX5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Skp1Q9WTX5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Skp1Q9WTX5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Skp1Q9WTX5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Skp1Q9WTX5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Skp1Q9WTX5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Skp1Q9WTX5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Skp1Q9WTX5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Skp1Q9WTX5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Skp1Q9WTX5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Skp1Q9WTX5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Skp1Q9WTX5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Skp1Q9WTX5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Skp1Q9WTX5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Skp1Q9WTX5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Skp1Q9WTX5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Skp1Q9WTX5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Skp1Q9WTX5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Skp1Q9WTX5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Skp1Q9WTX5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Skp1Q9WTX5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Skp1Q9WTX5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Skp1Q9WTX5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms