Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTK8

Spo11, Meiotic recombination protein SPO11, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spo11Q9WTK8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spo11Q9WTK8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spo11Q9WTK8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spo11Q9WTK8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spo11Q9WTK8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spo11Q9WTK8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spo11Q9WTK8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spo11Q9WTK8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spo11Q9WTK8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spo11Q9WTK8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spo11Q9WTK8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spo11Q9WTK8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spo11Q9WTK8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spo11Q9WTK8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spo11Q9WTK8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spo11Q9WTK8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spo11Q9WTK8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spo11Q9WTK8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spo11Q9WTK8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spo11Q9WTK8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spo11Q9WTK8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Spo11Q9WTK8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spo11Q9WTK8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spo11Q9WTK8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spo11Q9WTK8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spo11Q9WTK8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spo11Q9WTK8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spo11Q9WTK8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spo11Q9WTK8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spo11Q9WTK8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Spo11Q9WTK8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spo11Q9WTK8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spo11Q9WTK8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spo11Q9WTK8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spo11Q9WTK8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Spo11Q9WTK8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spo11Q9WTK8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spo11Q9WTK8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Spo11Q9WTK8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spo11Q9WTK8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spo11Q9WTK8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spo11Q9WTK8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spo11Q9WTK8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spo11Q9WTK8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spo11Q9WTK8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spo11Q9WTK8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spo11Q9WTK8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spo11Q9WTK8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spo11Q9WTK8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spo11Q9WTK8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spo11Q9WTK8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spo11Q9WTK8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spo11Q9WTK8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spo11Q9WTK8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spo11Q9WTK8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spo11Q9WTK8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spo11Q9WTK8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spo11Q9WTK8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spo11Q9WTK8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spo11Q9WTK8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spo11Q9WTK8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spo11Q9WTK8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spo11Q9WTK8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spo11Q9WTK8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spo11Q9WTK8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spo11Q9WTK8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spo11Q9WTK8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spo11Q9WTK8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spo11Q9WTK8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spo11Q9WTK8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spo11Q9WTK8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spo11Q9WTK8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spo11Q9WTK8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spo11Q9WTK8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spo11Q9WTK8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spo11Q9WTK8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spo11Q9WTK8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spo11Q9WTK8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spo11Q9WTK8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Spo11Q9WTK8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spo11Q9WTK8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spo11Q9WTK8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spo11Q9WTK8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spo11Q9WTK8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spo11Q9WTK8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spo11Q9WTK8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spo11Q9WTK8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spo11Q9WTK8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spo11Q9WTK8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spo11Q9WTK8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spo11Q9WTK8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spo11Q9WTK8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spo11Q9WTK8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spo11Q9WTK8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spo11Q9WTK8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spo11Q9WTK8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spo11Q9WTK8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spo11Q9WTK8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spo11Q9WTK8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spo11Q9WTK8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms