Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Y5

Hic1, Hypermethylated in cancer 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hic1Q9R1Y5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hic1Q9R1Y5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hic1Q9R1Y5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Hic1Q9R1Y5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hic1Q9R1Y5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hic1Q9R1Y5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hic1Q9R1Y5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hic1Q9R1Y5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Hic1Q9R1Y5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hic1Q9R1Y5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hic1Q9R1Y5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Hic1Q9R1Y5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hic1Q9R1Y5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Hic1Q9R1Y5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hic1Q9R1Y5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hic1Q9R1Y5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Hic1Q9R1Y5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hic1Q9R1Y5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hic1Q9R1Y5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hic1Q9R1Y5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hic1Q9R1Y5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hic1Q9R1Y5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hic1Q9R1Y5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hic1Q9R1Y5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hic1Q9R1Y5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hic1Q9R1Y5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Hic1Q9R1Y5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Hic1Q9R1Y5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hic1Q9R1Y5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hic1Q9R1Y5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Hic1Q9R1Y5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Hic1Q9R1Y5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Hic1Q9R1Y5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hic1Q9R1Y5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hic1Q9R1Y5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hic1Q9R1Y5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Hic1Q9R1Y5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hic1Q9R1Y5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hic1Q9R1Y5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hic1Q9R1Y5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hic1Q9R1Y5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hic1Q9R1Y5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hic1Q9R1Y5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hic1Q9R1Y5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hic1Q9R1Y5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hic1Q9R1Y5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hic1Q9R1Y5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Hic1Q9R1Y5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hic1Q9R1Y5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Hic1Q9R1Y5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hic1Q9R1Y5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hic1Q9R1Y5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hic1Q9R1Y5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hic1Q9R1Y5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Hic1Q9R1Y5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hic1Q9R1Y5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hic1Q9R1Y5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hic1Q9R1Y5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hic1Q9R1Y5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Hic1Q9R1Y5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hic1Q9R1Y5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hic1Q9R1Y5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hic1Q9R1Y5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hic1Q9R1Y5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hic1Q9R1Y5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hic1Q9R1Y5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hic1Q9R1Y5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hic1Q9R1Y5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hic1Q9R1Y5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hic1Q9R1Y5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hic1Q9R1Y5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hic1Q9R1Y5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Hic1Q9R1Y5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Hic1Q9R1Y5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hic1Q9R1Y5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hic1Q9R1Y5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hic1Q9R1Y5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hic1Q9R1Y5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hic1Q9R1Y5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hic1Q9R1Y5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hic1Q9R1Y5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hic1Q9R1Y5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hic1Q9R1Y5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hic1Q9R1Y5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hic1Q9R1Y5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hic1Q9R1Y5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hic1Q9R1Y5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hic1Q9R1Y5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hic1Q9R1Y5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hic1Q9R1Y5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hic1Q9R1Y5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hic1Q9R1Y5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hic1Q9R1Y5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hic1Q9R1Y5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hic1Q9R1Y5 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Hic1Q9R1Y5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hic1Q9R1Y5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hic1Q9R1Y5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hic1Q9R1Y5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hic1Q9R1Y5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms