Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R2

Trim3, Tripartite motif-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim3Q9R1R2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms