Protein–RNA interactions for Protein: Q9R155

Slc26a4, Pendrin, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc26a4Q9R155 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms