Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms