Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms