Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms