Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXJ1

Apbb1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb1Q9QXJ1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Apbb1Q9QXJ1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Apbb1Q9QXJ1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Apbb1Q9QXJ1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Apbb1Q9QXJ1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Apbb1Q9QXJ1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Apbb1Q9QXJ1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Apbb1Q9QXJ1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Apbb1Q9QXJ1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Apbb1Q9QXJ1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Apbb1Q9QXJ1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Apbb1Q9QXJ1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Apbb1Q9QXJ1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Apbb1Q9QXJ1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Apbb1Q9QXJ1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Apbb1Q9QXJ1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Apbb1Q9QXJ1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Apbb1Q9QXJ1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Apbb1Q9QXJ1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Apbb1Q9QXJ1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Apbb1Q9QXJ1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Apbb1Q9QXJ1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Apbb1Q9QXJ1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Apbb1Q9QXJ1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Apbb1Q9QXJ1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Apbb1Q9QXJ1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Apbb1Q9QXJ1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Apbb1Q9QXJ1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Apbb1Q9QXJ1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Apbb1Q9QXJ1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Apbb1Q9QXJ1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Apbb1Q9QXJ1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Apbb1Q9QXJ1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Apbb1Q9QXJ1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Apbb1Q9QXJ1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Apbb1Q9QXJ1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Apbb1Q9QXJ1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Apbb1Q9QXJ1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Apbb1Q9QXJ1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Apbb1Q9QXJ1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Apbb1Q9QXJ1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Apbb1Q9QXJ1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Apbb1Q9QXJ1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Apbb1Q9QXJ1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Apbb1Q9QXJ1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Apbb1Q9QXJ1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Apbb1Q9QXJ1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Apbb1Q9QXJ1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Apbb1Q9QXJ1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Apbb1Q9QXJ1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Apbb1Q9QXJ1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Apbb1Q9QXJ1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Apbb1Q9QXJ1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Apbb1Q9QXJ1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Apbb1Q9QXJ1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Apbb1Q9QXJ1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Apbb1Q9QXJ1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Apbb1Q9QXJ1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Apbb1Q9QXJ1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Apbb1Q9QXJ1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Apbb1Q9QXJ1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Apbb1Q9QXJ1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Apbb1Q9QXJ1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Apbb1Q9QXJ1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Apbb1Q9QXJ1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Apbb1Q9QXJ1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Apbb1Q9QXJ1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Apbb1Q9QXJ1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Apbb1Q9QXJ1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Apbb1Q9QXJ1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Apbb1Q9QXJ1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Apbb1Q9QXJ1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Apbb1Q9QXJ1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Apbb1Q9QXJ1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Apbb1Q9QXJ1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Apbb1Q9QXJ1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Apbb1Q9QXJ1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Apbb1Q9QXJ1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Apbb1Q9QXJ1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Apbb1Q9QXJ1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Apbb1Q9QXJ1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Apbb1Q9QXJ1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Apbb1Q9QXJ1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Apbb1Q9QXJ1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Apbb1Q9QXJ1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Apbb1Q9QXJ1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Apbb1Q9QXJ1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Apbb1Q9QXJ1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Apbb1Q9QXJ1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Apbb1Q9QXJ1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Apbb1Q9QXJ1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Apbb1Q9QXJ1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Apbb1Q9QXJ1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Apbb1Q9QXJ1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Apbb1Q9QXJ1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Apbb1Q9QXJ1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Apbb1Q9QXJ1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Apbb1Q9QXJ1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Apbb1Q9QXJ1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Apbb1Q9QXJ1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms