Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Limd1Q9QXD8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Limd1Q9QXD8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Limd1Q9QXD8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Limd1Q9QXD8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Limd1Q9QXD8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Limd1Q9QXD8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Limd1Q9QXD8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Limd1Q9QXD8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Limd1Q9QXD8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Limd1Q9QXD8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Limd1Q9QXD8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Limd1Q9QXD8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Limd1Q9QXD8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Limd1Q9QXD8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Limd1Q9QXD8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Limd1Q9QXD8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Limd1Q9QXD8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Limd1Q9QXD8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Limd1Q9QXD8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Limd1Q9QXD8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Limd1Q9QXD8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms