Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpc5Q9QX29 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpc5Q9QX29 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpc5Q9QX29 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpc5Q9QX29 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpc5Q9QX29 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpc5Q9QX29 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpc5Q9QX29 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpc5Q9QX29 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpc5Q9QX29 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpc5Q9QX29 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpc5Q9QX29 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpc5Q9QX29 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpc5Q9QX29 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpc5Q9QX29 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpc5Q9QX29 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpc5Q9QX29 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpc5Q9QX29 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpc5Q9QX29 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpc5Q9QX29 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpc5Q9QX29 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpc5Q9QX29 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpc5Q9QX29 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Trpc5Q9QX29 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trpc5Q9QX29 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trpc5Q9QX29 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trpc5Q9QX29 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpc5Q9QX29 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpc5Q9QX29 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpc5Q9QX29 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpc5Q9QX29 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpc5Q9QX29 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpc5Q9QX29 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpc5Q9QX29 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpc5Q9QX29 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpc5Q9QX29 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpc5Q9QX29 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpc5Q9QX29 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpc5Q9QX29 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpc5Q9QX29 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpc5Q9QX29 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpc5Q9QX29 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpc5Q9QX29 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpc5Q9QX29 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpc5Q9QX29 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpc5Q9QX29 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpc5Q9QX29 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpc5Q9QX29 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpc5Q9QX29 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpc5Q9QX29 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpc5Q9QX29 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpc5Q9QX29 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trpc5Q9QX29 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Trpc5Q9QX29 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trpc5Q9QX29 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpc5Q9QX29 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpc5Q9QX29 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpc5Q9QX29 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpc5Q9QX29 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpc5Q9QX29 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpc5Q9QX29 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpc5Q9QX29 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trpc5Q9QX29 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trpc5Q9QX29 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trpc5Q9QX29 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trpc5Q9QX29 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trpc5Q9QX29 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trpc5Q9QX29 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Trpc5Q9QX29 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trpc5Q9QX29 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trpc5Q9QX29 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpc5Q9QX29 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpc5Q9QX29 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpc5Q9QX29 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpc5Q9QX29 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpc5Q9QX29 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpc5Q9QX29 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpc5Q9QX29 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpc5Q9QX29 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpc5Q9QX29 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpc5Q9QX29 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpc5Q9QX29 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpc5Q9QX29 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpc5Q9QX29 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpc5Q9QX29 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trpc5Q9QX29 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trpc5Q9QX29 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trpc5Q9QX29 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trpc5Q9QX29 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trpc5Q9QX29 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trpc5Q9QX29 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpc5Q9QX29 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpc5Q9QX29 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpc5Q9QX29 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpc5Q9QX29 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpc5Q9QX29 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpc5Q9QX29 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpc5Q9QX29 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpc5Q9QX29 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpc5Q9QX29 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms