Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Homer2Q9QWW1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Homer2Q9QWW1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Homer2Q9QWW1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Homer2Q9QWW1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Homer2Q9QWW1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Homer2Q9QWW1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Homer2Q9QWW1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Homer2Q9QWW1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Homer2Q9QWW1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Homer2Q9QWW1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Homer2Q9QWW1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Homer2Q9QWW1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Homer2Q9QWW1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Homer2Q9QWW1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Homer2Q9QWW1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Homer2Q9QWW1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Homer2Q9QWW1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Homer2Q9QWW1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Homer2Q9QWW1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Homer2Q9QWW1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Homer2Q9QWW1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Homer2Q9QWW1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Homer2Q9QWW1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Homer2Q9QWW1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Homer2Q9QWW1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Homer2Q9QWW1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Homer2Q9QWW1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Homer2Q9QWW1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Homer2Q9QWW1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Homer2Q9QWW1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Homer2Q9QWW1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Homer2Q9QWW1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Homer2Q9QWW1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Homer2Q9QWW1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Homer2Q9QWW1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Homer2Q9QWW1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Homer2Q9QWW1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Homer2Q9QWW1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Homer2Q9QWW1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Homer2Q9QWW1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Homer2Q9QWW1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Homer2Q9QWW1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Homer2Q9QWW1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Homer2Q9QWW1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Homer2Q9QWW1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Homer2Q9QWW1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Homer2Q9QWW1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Homer2Q9QWW1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Homer2Q9QWW1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Homer2Q9QWW1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Homer2Q9QWW1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Homer2Q9QWW1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Homer2Q9QWW1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Homer2Q9QWW1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Homer2Q9QWW1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Homer2Q9QWW1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Homer2Q9QWW1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Homer2Q9QWW1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Homer2Q9QWW1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Homer2Q9QWW1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Homer2Q9QWW1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Homer2Q9QWW1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Homer2Q9QWW1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Homer2Q9QWW1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Homer2Q9QWW1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Homer2Q9QWW1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Homer2Q9QWW1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Homer2Q9QWW1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Homer2Q9QWW1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Homer2Q9QWW1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Homer2Q9QWW1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Homer2Q9QWW1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Homer2Q9QWW1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Homer2Q9QWW1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Homer2Q9QWW1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Homer2Q9QWW1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Homer2Q9QWW1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Homer2Q9QWW1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Homer2Q9QWW1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Homer2Q9QWW1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Homer2Q9QWW1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Homer2Q9QWW1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Homer2Q9QWW1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Homer2Q9QWW1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Homer2Q9QWW1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Homer2Q9QWW1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Homer2Q9QWW1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Homer2Q9QWW1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Homer2Q9QWW1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Homer2Q9QWW1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Homer2Q9QWW1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Homer2Q9QWW1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Homer2Q9QWW1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Homer2Q9QWW1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms