Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Chaf1aQ9QWF0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chaf1aQ9QWF0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Chaf1aQ9QWF0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Chaf1aQ9QWF0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chaf1aQ9QWF0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Chaf1aQ9QWF0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chaf1aQ9QWF0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chaf1aQ9QWF0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Chaf1aQ9QWF0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Chaf1aQ9QWF0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chaf1aQ9QWF0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Chaf1aQ9QWF0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chaf1aQ9QWF0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Chaf1aQ9QWF0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chaf1aQ9QWF0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Chaf1aQ9QWF0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chaf1aQ9QWF0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chaf1aQ9QWF0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Chaf1aQ9QWF0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chaf1aQ9QWF0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Chaf1aQ9QWF0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chaf1aQ9QWF0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chaf1aQ9QWF0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chaf1aQ9QWF0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Chaf1aQ9QWF0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Chaf1aQ9QWF0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chaf1aQ9QWF0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chaf1aQ9QWF0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chaf1aQ9QWF0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chaf1aQ9QWF0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chaf1aQ9QWF0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chaf1aQ9QWF0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Chaf1aQ9QWF0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Chaf1aQ9QWF0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chaf1aQ9QWF0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chaf1aQ9QWF0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Chaf1aQ9QWF0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chaf1aQ9QWF0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chaf1aQ9QWF0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Chaf1aQ9QWF0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Chaf1aQ9QWF0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Chaf1aQ9QWF0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Chaf1aQ9QWF0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Chaf1aQ9QWF0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Chaf1aQ9QWF0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chaf1aQ9QWF0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chaf1aQ9QWF0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chaf1aQ9QWF0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chaf1aQ9QWF0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chaf1aQ9QWF0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chaf1aQ9QWF0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chaf1aQ9QWF0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chaf1aQ9QWF0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chaf1aQ9QWF0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chaf1aQ9QWF0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chaf1aQ9QWF0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chaf1aQ9QWF0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chaf1aQ9QWF0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chaf1aQ9QWF0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chaf1aQ9QWF0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chaf1aQ9QWF0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Chaf1aQ9QWF0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chaf1aQ9QWF0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Chaf1aQ9QWF0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chaf1aQ9QWF0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chaf1aQ9QWF0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chaf1aQ9QWF0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chaf1aQ9QWF0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chaf1aQ9QWF0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chaf1aQ9QWF0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chaf1aQ9QWF0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Chaf1aQ9QWF0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chaf1aQ9QWF0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chaf1aQ9QWF0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chaf1aQ9QWF0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chaf1aQ9QWF0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chaf1aQ9QWF0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chaf1aQ9QWF0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Chaf1aQ9QWF0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chaf1aQ9QWF0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chaf1aQ9QWF0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chaf1aQ9QWF0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chaf1aQ9QWF0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chaf1aQ9QWF0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chaf1aQ9QWF0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chaf1aQ9QWF0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chaf1aQ9QWF0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chaf1aQ9QWF0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chaf1aQ9QWF0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chaf1aQ9QWF0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chaf1aQ9QWF0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chaf1aQ9QWF0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Chaf1aQ9QWF0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chaf1aQ9QWF0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chaf1aQ9QWF0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chaf1aQ9QWF0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chaf1aQ9QWF0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Chaf1aQ9QWF0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chaf1aQ9QWF0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms