Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rai2Q9QVY8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rai2Q9QVY8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rai2Q9QVY8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rai2Q9QVY8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rai2Q9QVY8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rai2Q9QVY8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rai2Q9QVY8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rai2Q9QVY8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rai2Q9QVY8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms