Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Mid2Q9QUS6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms