Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms