Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sfmbt1Q9JMD1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sfmbt1Q9JMD1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sfmbt1Q9JMD1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sfmbt1Q9JMD1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sfmbt1Q9JMD1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sfmbt1Q9JMD1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sfmbt1Q9JMD1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sfmbt1Q9JMD1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sfmbt1Q9JMD1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sfmbt1Q9JMD1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sfmbt1Q9JMD1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sfmbt1Q9JMD1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sfmbt1Q9JMD1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sfmbt1Q9JMD1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sfmbt1Q9JMD1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sfmbt1Q9JMD1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sfmbt1Q9JMD1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sfmbt1Q9JMD1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sfmbt1Q9JMD1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sfmbt1Q9JMD1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sfmbt1Q9JMD1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sfmbt1Q9JMD1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sfmbt1Q9JMD1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sfmbt1Q9JMD1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Sfmbt1Q9JMD1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sfmbt1Q9JMD1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sfmbt1Q9JMD1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sfmbt1Q9JMD1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sfmbt1Q9JMD1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sfmbt1Q9JMD1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sfmbt1Q9JMD1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sfmbt1Q9JMD1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sfmbt1Q9JMD1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Sfmbt1Q9JMD1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sfmbt1Q9JMD1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sfmbt1Q9JMD1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sfmbt1Q9JMD1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sfmbt1Q9JMD1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sfmbt1Q9JMD1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sfmbt1Q9JMD1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sfmbt1Q9JMD1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sfmbt1Q9JMD1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sfmbt1Q9JMD1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sfmbt1Q9JMD1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sfmbt1Q9JMD1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sfmbt1Q9JMD1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sfmbt1Q9JMD1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sfmbt1Q9JMD1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sfmbt1Q9JMD1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sfmbt1Q9JMD1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sfmbt1Q9JMD1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sfmbt1Q9JMD1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sfmbt1Q9JMD1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sfmbt1Q9JMD1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Sfmbt1Q9JMD1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sfmbt1Q9JMD1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sfmbt1Q9JMD1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sfmbt1Q9JMD1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sfmbt1Q9JMD1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Sfmbt1Q9JMD1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sfmbt1Q9JMD1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Sfmbt1Q9JMD1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sfmbt1Q9JMD1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sfmbt1Q9JMD1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sfmbt1Q9JMD1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sfmbt1Q9JMD1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sfmbt1Q9JMD1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sfmbt1Q9JMD1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sfmbt1Q9JMD1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sfmbt1Q9JMD1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sfmbt1Q9JMD1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sfmbt1Q9JMD1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sfmbt1Q9JMD1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sfmbt1Q9JMD1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sfmbt1Q9JMD1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sfmbt1Q9JMD1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sfmbt1Q9JMD1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sfmbt1Q9JMD1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sfmbt1Q9JMD1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sfmbt1Q9JMD1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Sfmbt1Q9JMD1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sfmbt1Q9JMD1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sfmbt1Q9JMD1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sfmbt1Q9JMD1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sfmbt1Q9JMD1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sfmbt1Q9JMD1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sfmbt1Q9JMD1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sfmbt1Q9JMD1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms