Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cul3Q9JLV5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms