Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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Tgm1Q9JLF6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tgm1Q9JLF6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tgm1Q9JLF6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tgm1Q9JLF6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tgm1Q9JLF6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tgm1Q9JLF6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tgm1Q9JLF6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tgm1Q9JLF6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tgm1Q9JLF6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tgm1Q9JLF6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tgm1Q9JLF6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tgm1Q9JLF6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms