Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC6

Tef, Thyrotroph embryonic factor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefQ9JLC6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TefQ9JLC6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TefQ9JLC6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TefQ9JLC6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TefQ9JLC6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TefQ9JLC6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TefQ9JLC6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TefQ9JLC6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TefQ9JLC6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TefQ9JLC6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TefQ9JLC6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TefQ9JLC6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TefQ9JLC6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TefQ9JLC6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TefQ9JLC6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TefQ9JLC6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TefQ9JLC6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TefQ9JLC6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TefQ9JLC6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TefQ9JLC6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TefQ9JLC6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TefQ9JLC6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TefQ9JLC6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TefQ9JLC6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TefQ9JLC6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TefQ9JLC6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TefQ9JLC6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TefQ9JLC6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TefQ9JLC6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TefQ9JLC6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TefQ9JLC6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TefQ9JLC6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TefQ9JLC6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TefQ9JLC6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TefQ9JLC6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TefQ9JLC6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TefQ9JLC6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TefQ9JLC6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TefQ9JLC6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TefQ9JLC6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TefQ9JLC6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TefQ9JLC6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TefQ9JLC6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TefQ9JLC6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TefQ9JLC6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TefQ9JLC6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TefQ9JLC6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TefQ9JLC6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TefQ9JLC6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TefQ9JLC6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TefQ9JLC6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TefQ9JLC6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TefQ9JLC6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TefQ9JLC6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TefQ9JLC6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TefQ9JLC6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TefQ9JLC6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TefQ9JLC6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TefQ9JLC6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TefQ9JLC6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TefQ9JLC6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TefQ9JLC6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TefQ9JLC6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TefQ9JLC6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TefQ9JLC6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TefQ9JLC6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TefQ9JLC6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TefQ9JLC6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TefQ9JLC6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TefQ9JLC6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TefQ9JLC6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TefQ9JLC6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TefQ9JLC6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TefQ9JLC6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TefQ9JLC6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TefQ9JLC6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TefQ9JLC6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TefQ9JLC6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TefQ9JLC6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TefQ9JLC6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TefQ9JLC6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TefQ9JLC6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TefQ9JLC6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TefQ9JLC6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TefQ9JLC6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TefQ9JLC6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TefQ9JLC6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TefQ9JLC6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TefQ9JLC6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TefQ9JLC6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TefQ9JLC6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TefQ9JLC6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TefQ9JLC6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TefQ9JLC6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TefQ9JLC6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TefQ9JLC6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TefQ9JLC6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TefQ9JLC6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TefQ9JLC6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TefQ9JLC6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms