Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nectin3Q9JLB9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nectin3Q9JLB9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nectin3Q9JLB9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nectin3Q9JLB9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nectin3Q9JLB9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nectin3Q9JLB9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nectin3Q9JLB9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nectin3Q9JLB9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nectin3Q9JLB9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nectin3Q9JLB9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nectin3Q9JLB9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nectin3Q9JLB9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nectin3Q9JLB9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nectin3Q9JLB9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nectin3Q9JLB9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nectin3Q9JLB9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nectin3Q9JLB9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nectin3Q9JLB9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nectin3Q9JLB9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nectin3Q9JLB9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nectin3Q9JLB9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nectin3Q9JLB9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nectin3Q9JLB9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nectin3Q9JLB9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nectin3Q9JLB9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nectin3Q9JLB9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nectin3Q9JLB9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nectin3Q9JLB9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nectin3Q9JLB9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nectin3Q9JLB9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nectin3Q9JLB9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nectin3Q9JLB9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nectin3Q9JLB9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nectin3Q9JLB9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nectin3Q9JLB9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nectin3Q9JLB9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nectin3Q9JLB9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nectin3Q9JLB9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nectin3Q9JLB9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nectin3Q9JLB9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms