Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL21

Ccr10, C-C chemokine receptor type 10, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr10Q9JL21 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccr10Q9JL21 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccr10Q9JL21 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccr10Q9JL21 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccr10Q9JL21 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccr10Q9JL21 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccr10Q9JL21 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccr10Q9JL21 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccr10Q9JL21 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccr10Q9JL21 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccr10Q9JL21 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccr10Q9JL21 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccr10Q9JL21 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccr10Q9JL21 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccr10Q9JL21 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccr10Q9JL21 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccr10Q9JL21 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccr10Q9JL21 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccr10Q9JL21 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccr10Q9JL21 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccr10Q9JL21 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccr10Q9JL21 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccr10Q9JL21 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccr10Q9JL21 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccr10Q9JL21 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccr10Q9JL21 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccr10Q9JL21 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccr10Q9JL21 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccr10Q9JL21 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccr10Q9JL21 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccr10Q9JL21 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccr10Q9JL21 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccr10Q9JL21 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccr10Q9JL21 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccr10Q9JL21 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccr10Q9JL21 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccr10Q9JL21 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccr10Q9JL21 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccr10Q9JL21 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccr10Q9JL21 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccr10Q9JL21 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccr10Q9JL21 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccr10Q9JL21 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccr10Q9JL21 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccr10Q9JL21 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccr10Q9JL21 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccr10Q9JL21 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccr10Q9JL21 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccr10Q9JL21 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccr10Q9JL21 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccr10Q9JL21 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccr10Q9JL21 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccr10Q9JL21 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccr10Q9JL21 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccr10Q9JL21 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccr10Q9JL21 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccr10Q9JL21 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccr10Q9JL21 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccr10Q9JL21 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccr10Q9JL21 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccr10Q9JL21 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccr10Q9JL21 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccr10Q9JL21 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccr10Q9JL21 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccr10Q9JL21 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccr10Q9JL21 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccr10Q9JL21 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccr10Q9JL21 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccr10Q9JL21 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccr10Q9JL21 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccr10Q9JL21 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccr10Q9JL21 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccr10Q9JL21 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccr10Q9JL21 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccr10Q9JL21 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccr10Q9JL21 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccr10Q9JL21 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccr10Q9JL21 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccr10Q9JL21 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccr10Q9JL21 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccr10Q9JL21 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccr10Q9JL21 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccr10Q9JL21 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccr10Q9JL21 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccr10Q9JL21 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccr10Q9JL21 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccr10Q9JL21 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccr10Q9JL21 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccr10Q9JL21 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccr10Q9JL21 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccr10Q9JL21 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccr10Q9JL21 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccr10Q9JL21 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccr10Q9JL21 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccr10Q9JL21 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccr10Q9JL21 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccr10Q9JL21 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccr10Q9JL21 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccr10Q9JL21 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccr10Q9JL21 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms