Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms