Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pole3Q9JKP7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pole3Q9JKP7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pole3Q9JKP7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pole3Q9JKP7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pole3Q9JKP7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pole3Q9JKP7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pole3Q9JKP7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pole3Q9JKP7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pole3Q9JKP7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pole3Q9JKP7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pole3Q9JKP7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pole3Q9JKP7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pole3Q9JKP7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pole3Q9JKP7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pole3Q9JKP7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pole3Q9JKP7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pole3Q9JKP7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pole3Q9JKP7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pole3Q9JKP7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pole3Q9JKP7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pole3Q9JKP7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pole3Q9JKP7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pole3Q9JKP7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pole3Q9JKP7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pole3Q9JKP7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pole3Q9JKP7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pole3Q9JKP7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pole3Q9JKP7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pole3Q9JKP7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pole3Q9JKP7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pole3Q9JKP7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pole3Q9JKP7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pole3Q9JKP7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pole3Q9JKP7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pole3Q9JKP7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pole3Q9JKP7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pole3Q9JKP7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pole3Q9JKP7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pole3Q9JKP7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pole3Q9JKP7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pole3Q9JKP7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pole3Q9JKP7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pole3Q9JKP7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pole3Q9JKP7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pole3Q9JKP7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pole3Q9JKP7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pole3Q9JKP7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pole3Q9JKP7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pole3Q9JKP7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pole3Q9JKP7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pole3Q9JKP7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pole3Q9JKP7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pole3Q9JKP7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pole3Q9JKP7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pole3Q9JKP7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pole3Q9JKP7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pole3Q9JKP7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pole3Q9JKP7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pole3Q9JKP7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pole3Q9JKP7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pole3Q9JKP7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pole3Q9JKP7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pole3Q9JKP7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pole3Q9JKP7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pole3Q9JKP7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pole3Q9JKP7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pole3Q9JKP7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pole3Q9JKP7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pole3Q9JKP7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pole3Q9JKP7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pole3Q9JKP7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pole3Q9JKP7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pole3Q9JKP7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pole3Q9JKP7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pole3Q9JKP7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pole3Q9JKP7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pole3Q9JKP7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pole3Q9JKP7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pole3Q9JKP7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pole3Q9JKP7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pole3Q9JKP7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pole3Q9JKP7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pole3Q9JKP7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pole3Q9JKP7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pole3Q9JKP7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pole3Q9JKP7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pole3Q9JKP7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pole3Q9JKP7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pole3Q9JKP7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pole3Q9JKP7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pole3Q9JKP7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pole3Q9JKP7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pole3Q9JKP7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pole3Q9JKP7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pole3Q9JKP7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pole3Q9JKP7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pole3Q9JKP7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pole3Q9JKP7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms